Endosymbiose ist eine Vereinigung von Arten, bei der eine von ihnen in der anderen lebt. Bestimmte Organellen eukaryotischer Zellen wie Chloroplasten und Mitochondrien, die aus ihrer ursprünglichen Symbiose mit einigen Bakterien stammen. Während der Endosymbiose nimmt das symbiotische Element den intrazellulären Raum des Wirts ein. Ein Beispiel für diese Proben sind: zooxanthellae, die eine sind Spezies von Algen, die die Zellen einiger Korallen bewohnen.
Die endosymbiotische Theorie besagt, dass eine eukaryotische Zelle die Fähigkeit hat, sich an eine andere zu binden, um eine Koexistenz aufrechtzuerhalten, von der beide profitieren, da der Wirt die vom Endosymbionten freigesetzten Früchte genießen würde. Andererseits bestätigt diese Theorie auch, dass die ersten Organellen, die sich entwickelten, die Mitochondrien waren und der serielle eukaryotische Korpuskel dann durch serielle Endosymbiose einen Endosymbionten erhält, der in der Lage ist, Photosynthese durchzuführen, die später eukaryotische zelluläre Organellen entwickeln würde, die kommen würden um die ersten Grünalgen zu erzeugen.
Es gibt bestimmte Hinweise darauf, dass Mitochondrien und Plastiden aus dem Endosymbiose-Prozess hervorgehen. Eine davon ist die Größe der Mitochondrien, die der einiger Bakterien ähnelt. Sowohl Chloroplasten als auch Mitochondrien bestehen aus kovalent geschlossener zirkulärer doppelsträngiger DNA. Sie sind mit einem doppelten Stoff überzogen. Chloroplasten und Mitochondrien werden ebenso wie Prokaryoten durch binäre Spaltung geteilt. Die Proteinsynthese sowohl in Mitochondrien als auch in Chloroplasten ist unabhängig.